Holzfenster haben den Vorteil, dass sie aus nachwachsenden Rohstoffen hergestellt werden. Werden sie mit umweltfreundlichen Lacken oder Lasuren behandelt, können sie anschließend problemlos entsorgt werden. Sie lassen sich in jeder beliebigen Farbe streichen oder lasieren, die Farbe lässt sich im Lebenszyklus des Fensters ändern.

Moderne Holzfenster sind bei entsprechender Pflege langlebige Bauelemente. Je nach Ausrichtung der Fassade ist mit Renovierungszyklen ab zehn Jahren zu rechnen. Holzfenster halten bei guter Qualität mechanischen Dauerbeanspruchungen. Bei Dreischeibenfenstern aus Holz ist auf Beschläge zu achten, die den höheren Belastungen standhalten. Es gibt eine große Vielfalt an Maßen und Formen. Moderne Holzfenster verziehen sich auch bei großen Temperaturschwankungen nicht.

Der Pflegeaufwand ist in der Regel größer im Vergleich zu Fenstern aus Kunststoff oder Alu. Das lässt sich durch eine Kombination von Holz und Alu ausgleichen, allerdings zulasten der Holzoptik an der Außenseite der Fassade.

Holzfenster sind schwerer als Fenster aus Kunststoff. Sie sind teurer als Kunststofffenster. Den Preis für ein Fenster von 1,3 auf 1,3 m gibt der Verband Fenster + Fassade (VFF) mit im Durchschnitt 590 Euro an (Stand Juli 2011).